本发明公开了一种小型高精度深腔四脊波导圆极化器的加工方法，涉及高频微波精密器件加工领域。本发明首先对不能整体加工的小型高精度深腔四脊波导圆极化器进行结构分析，将其分解成可直接加工并同时满足数量少和加工难度低的子结构；然后对拆分出的子结构进行定位设计、连接设计和加工及装配涉及的辅助结构设计；接着对各子结构进行分别加工，并在组装后加工去除多余部分，完成小型高精度深腔四脊波导圆极化器的加工。本发明易于实施，可以有效地实现小型高精度深腔四脊波导圆极化器的加工，能较好地适应不同特征小型精密微波器件的加工，是对现有技术的一种重要改进。