本发明公开了一种计及SOC排序的储能AGC分配PCS有功功率的方法及系统，本发明方法包括获取各PCS对应电池的SOC值；将电池的SOC值进行排序，并根据SOC值的排序设定各PCS的优先级；将AGC下发功率按照各PCS的优先级，结合各PCS的最大可充/放最大功率值依次下发给各PCS直至AGC下发功率全部分配完毕。本发明能够兼顾功率充放与电池一致性、SOC均衡的要求，在满足功率调度的情况下，兼顾电池的一致性与SOC在充放电过程中的均衡，减少电池的不一致性，提供给电力调度部门最准确的控制信息。