本发明公开一种六模光纤的自适应概率成形方法及系统，涉及光纤通信技术领域，包括：获取六模光纤的六个模式的模场；根据六个模式的模场得到六模光纤的模式串扰；确定六模光纤的非简并模之间存在的模式时延；根据模式串扰和模式时延建立六模光纤信道模型；将原始信号输入六模光纤信道模型，得到输出信号；原始信号和输出信号均为六路16QAM信号；对比原始信号和输出信号，得到六模光纤的误码分布；根据六模光纤的误码分布确定原始信号中容易出现误码的信号和不容易出现误码的信号；对原始信号进行反馈调节，降低容易出现误码的信号的概率，提高不容易出现误码的信号的概率。本发明能够降低误码率。