本发明提供一种道岔侧冲区域防护方法及系统，包括：确定道岔区域管理划分原则；对照道岔关联列车计划列表，获取目标列车和侧冲防护列车；基于所述道岔区域管理划分原则，确定预设移动授权策略；基于所述预设移动授权策略，实现所述侧冲防护列车相对于所述目标列车的侧冲防护。本发明通过基于道岔精细化管理划分，以及设定列车移动授权机制，提高了道岔资源利用率，还提高列车折返效率，并且有效避免了其他列车进入道岔的侧冲防护区域及关联侧冲防护区域中，保证了行车安全。