本发明公开了大丽轮枝菌VdPRMT1基因在提高作物抗病性中的用途。本发明采用寄主诱导的基因沉默技术以大丽轮枝菌菌株为材料构建多个针对大丽轮枝菌VdPRMT1基因的烟草脆裂病毒干扰质粒，转化本氏烟草并进行大丽轮枝菌接种，初步确定大丽轮枝菌中VdPRMT1基因与致病性存在关联性。本发明进一步以大丽轮枝菌的VdPRMT1作为靶标基因，利用转基因和RNAi技术相结合，筛选获得能够显著提高植物抗病性的靶标基因片段。本发明所筛选的靶标基因片段以及应用该靶标基因片段所构建的Gateway干扰载体可应用于提高植物对大丽轮枝菌所导致疾病的抗性以及培育抗大丽轮枝菌的转基因植物新品种等方面。