本发明公开了一种用于输入串联结构的均压电容调节器及其控制方法，均压电容调节器包括多个均压电容，相邻两个均压电容之间通过均压单元连接；均压单元包括两条并联的均压支路；第一均压支路包括依次连接的第一逆变电路、第一谐振电路、第一高频变压器和第一整流电路；第二均压支路包括依次连接的第二整流电路、第二高频变压器、第二谐振电路和第二逆变电路；其中第一逆变电路、第二整流电路一端均与第一均压电容连接；第一整流电路、第二逆变电路一端均与第二均压电容。本发明解决了在自取能时旁路冲击电流过大、均压电容掉电后子模块控制器无法向主控制器发送子模块状态信息、均压电容掉电后旁路开关误动作、以及启动时均压电容电压发散的问题。