本发明属于微藻多糖制备技术领域，具体涉及一种具有抗氧化活性的微拟球藻多糖的制备方法。通过超声波—微波—酶法协同提取微拟球藻内多糖，提取时充分结合了超声波对微拟球藻藻粉的空化破碎效果、微波对微拟球藻藻粉所造成的高能作用以及酶所对微拟球藻藻粉细胞壁的高效专一性质，增大了其内部多糖的溶出，大大提高了微拟球藻多糖的提取率；本发明对提取的微拟球藻多糖进行α‑淀粉酶修饰，改变多糖结构，使多糖空间结构上的剪切修饰后多糖的基团及结构发生变化，从而导致其物理化学性质可在不同程度上得到改变，以至提高其生物学活性，经修饰后的微拟球藻多糖DPPH自由基清除率(‑Sa/％)可由为经修饰的61.5％提升至78.9％，提升率为28.29％。