本发明涉及一种红外探测器视频模拟信号采集处理方法及系统。解决探测器输出像素速率与ADC采样不批配的问题。本发明针对低像素率探测器输出的视频模拟信号进行模数转换，采用采样速率为2倍或数倍于该像素读出速率的ADC模数转换器，通过对同一像素进行多次采样(与ADC模数转换器采样速率和红外探测器像素输出频率的比值相关)，将多次采样位置较平稳、图像相对灰度起伏较小的平坦区域的数字信号相加求取平均后的信号作为该像素的有效量化值。很好的解决了探测器输出像素速率与ADC采样速率不批配的问题，保障高性能ADC可以用于低像素率的图像系统中，并有效提高图像质量。