一种提高继电保护可靠性的系统，包括继电保护可靠性提高装置，继电保护可靠性提高装置中：采样计算模块对输电线路进行保护和启动两路采样，并对获得的采样信号进行快速傅里叶变换，以获得对应的保护FFT计算值、启动FFT计算值；相比互校验模块将保护FFT计算值、启动FFT计算值进行相比互校验，以获得第一校验结果；采样异常大数据校验模块将保护FFT计算值、启动FFT计算值进行采样异常大数据校验，以获得第二校验结果；继电器闭合模块将第一校验结果、第二校验结果进行逻辑或运算，在逻辑或运算结果为真时，输送闭锁信号给继电器，以使其进行保护工作。本发明还提供一种提高继电保护可靠性的方法。