本发明涉及一种用于柔直系统高频振荡控制的锁相环相位补偿方法及系统，其包括以下步骤：对预先获取的静止坐标系下电网实际电压信号及实际电流信号进行预处理后，进行abc/dq坐标变换，生成旋转坐标系下的电网电流测量信号向量以及电网电压测量信号向量；将旋转坐标系下的电网电流测量信号向量以及电网电压测量信号向量输入到柔直变流器电流内环控制器，得到旋转坐标系下的电压参考信号；根据柔直系统中待抑制高频振荡的频率范围，确定相角补偿值，基于确定的相角补偿值对旋转坐标系下的电压参考信号进行dq/abc变换，生成静止坐标系下的电压信号。本发明可以广泛应用于电力系统稳定性分析技术领域。