本公开提出一种串列式双风轮发电系统的控制方法、装置及控制系统，涉及风力发电技术领域。其中，所述串列式双风轮发电系统，包括：三端口变流器；其中，所述三端口变流器包括：机侧变流器1、机侧变流器2及网侧变流器3；所述机侧变流器1与前风轮发电机连接，所述机侧变流器2与后风轮发电机连接，所述网侧变流器3与电网相连；所述方法，包括：获取当前的来流风速、所述串列式双风轮发电系统当前的风机转速、输出电压及电流；根据所述风机转速、所述来流风速、输出电压及电流，控制所述串列式双风轮发电系统中发电机的工作状态。由此，通过控制发电机的工作状态，可以平衡风机的输出功率，维持风机的稳定性，从而提高串列式双风轮发电系统的稳定性和可靠性。