本发明提出了一种基于微电网的能量交互优化方法及系统，包括：根据负荷与分布式能源机组、储能装置之间的供电关系，将配电网划分为若干个微电网；对可再生能源机组进行风险预测；分别获取储能装置和非可再生能源机组的运行成本；根据风险预测的结果和运行成本，结合微电网之间的能量交互成本构建成本目标函数，确定微电网在能量交互时的状态约束和功率约束；在同时满足状态约束和功率约束的情况下，对成本目标函数进行求解，根据求解结果调整各个微电网在能量交互时的功率。在成本目标函数中引入了向其他微电网购售电的功率，在降低多微电网运行成本的同时，能够减少用电高峰期微电网与电网之间能量交互的功率。