本发明提供的河道堤岸绿色低碳生态净水系统，涉及水环境治理技术领域，包括依次连接的生态滤坝、储水槽和生态塘，生态滤坝由不同填料层堆砌成阶梯型，通过设计阶梯型坝体内部溢流口的位置使得坝体内部水流呈折流式，坝体顶部放置植物板种植植物；储水槽设置消力坎和尾槛，底部设置管道与生态塘底部相连；生态塘内部水体悬挂植物浮板和生物绳，外部设有植物缓冲带；本发明充分利用河道生态系统的低洼坑塘，阶梯型滤坝前端充当河岸堤坝，后端跌水补充水体溶解氧；生态塘从底部进水解决塘底死水问题，管道布置可实现丰水期河道快速排水，枯水期河道直接补水；本发明中系统水体自流、跌水曝气，通过绿色低碳的方式对水体进行净化，同时发挥景观作用。