本发明涉及一种重离子微孔膜生产终端控制系统，包括第一层网络控制结构，重离子微孔膜生产终端的各装置连接前端服务器，前端服务器实时获取重离子微孔膜生产终端生产状态数据，对重离子微孔膜生产终端的各装置分别进行控制；第二层网络控制结构，前端服务器将获取的生产状态数据汇聚通后发送到核心服务端控制器，核心服务端控制器对重离子微孔膜生产终端的各装置进行管理和控制；第三层网络控制结构，核心服务端控制器与总控客户端进行数据交互，总控客户端用于对整个辐照生产终端生产进行查看、管理和控制；其中，重离子微孔膜生产终端的各装置与总控客户端之间采用分布式部署。本发明可以实现重离子微孔膜的全自动高密度辐照生产。