本发明提供了一种航天器的电源装置、航天器电源控制器及控制方法，该电源装置包括前级MPPT电路和后级S3R电路，所述前级MPPT电路与所述后级S3R电路相连，所述后级S3R电路用于实现分流调节功能，该电源装置具有MPPT工作模式与分流调节模式两种工作状态，具有自主切换MPPT模式和S3R模式的功能，在保证最大功率输出的同时，可以主动切换至S3R模式将前级输出功率传输到母线上。本发明的有益效果是：本发明的电源装置具有自主切换MPPT模式与S3R模式功能，无需增加后级变换器，兼具高太阳电池转换电能利用率与高功率传递效率的优点。