本发明提供了一种室内环境的除菌方法及环境调节系统。该室内环境的除菌方法包括：向至少一个用户终端提供对所述室内环境进行除菌的提示信息；接收任意一个所述用户终端响应于所述提示信息的确认指令；利用环境调节设备对所述室内环境进行除菌。本发明可通过用户终端对环境调节设备进行远程控制，在向用户提供提示信息后，需接收到用户的确认指令才开始对室内环境进行除菌，避免了用户因未看到提示信息在除菌的过程中返回或停留在室内环境的情况发生，减少了安全隐患。