发明提供一种堤坝渗漏入口探测装置及其探测方法。该探测装置包括水上漂浮平台、层析扫描探测系统、示踪剂释放系统和数据处理系统。该方法包括确定勘察范围，划分勘察网格、规划测量路线、测量待测水域以及示踪剂的电导率、仪器布置、试验测量、数据处理、图像处理与分析、渗漏流速流向计算以及渗漏入口定位等步骤。该方法结合了层析扫描、示踪法、图像变化检测与测速等技术的优点，并通过水上操作平台实现水上工作，极大的提高了针对水库深水库区渗漏通道的探测精度与探测效率。