本发明涉及一种裂隙模拟结构、裂隙动水封堵试验装置及其方法，属于裂隙封堵试验技术领域，该结构包括相互扣合的第一模具和第二模具，第一模具和第二模具之间的间隙形成裂隙，第一模具的顶面在裂隙中心线的两侧设有凹槽，第二模具的底面设有凸起，所述凸起插在凹槽内，且与凹槽的内壁密封连接，凸起能够在所述凹槽中拔出，所述凹槽内能够放置垫片来控制凸起的插入深度从而调整第一模具和第二模具之间的间隙。该装置能实现潮汐作用下多种裂隙开度、角度的注浆封堵试验，为滨海岩溶区注浆堵水提供指导。