本公开提供一种治疗或改善多囊卵巢综合征的中药组合物及其制备方法和应用，其中中药组合物包括以下原料：菟丝子、紫河车、茯苓、葛根、石楠叶、丹参、麸炒苍术、制巴戟天、熟地黄、炙淫羊藿、皂角刺、鹿角、龙胆草、炒决明子、净山楂、泽泻、荷叶、盐车前子。本公开提供的中药组合物及其制备方法和应用，可以同时改善多囊卵巢综合征的生殖障碍及代谢异常，能够明显提高肠道中的SCFA水平；降低血清TNF‑α、IL‑1β、IL‑6等促炎因子水平，从而改善慢性低反应性炎症；并提高脂肪、骨骼肌、卵巢组织中脂联素受体水平，最终明显改善多囊卵巢综合征的胰岛素抵抗；并且能够改善多囊卵巢综合征的卵巢功能及卵泡的成熟及发育。