本发明公开了一种作物冠层结构动态生长模型建立方法、系统、可存储介质，涉及植物生长分析技术领域。本发明探究作物冠层结构特征及作物发育过程间的变化规律，建立作物冠层三维结构模型，并融合构建玉米动态生长模拟。模型中采用生长度日来描述作物生长发育阶段，采用Logistic方程进行玉米冠层二维结构的动态模拟，采用空间拓扑结构分别进行叶脉、叶片边缘等的表征，在此基础上，最终创建了作物冠层三维空间结构的动态模拟方法，实现复杂农田生态系统中水热碳多过程的耦合模拟，有效提升作物模型的模拟能力和普适性。