本发明公开了一种细菌纤维素/氮化硼复合高导热柔性薄膜材料及其制备方法，属于导热材料技术领域。本发明通过改性剂对氮化硼填料进行表面改性处理，并在细菌纤维素分散液中均匀分散、交联键合，进一步抽滤得到薄膜；经热压处理后，将细菌纤维素碳化，使其导热性能大幅度提升，同时消除薄膜空隙，在氮化硼和碳化细菌纤维素之间构筑导热通路，获得具备高导热性能的薄膜；将经有机溶剂稀释的环氧树脂均匀喷涂在导热薄膜的表面，经热压处理，环氧树脂与氮化硼、碳化细菌纤维素表面的不饱和基团反应交联，提升了导热薄膜表面的韧性和力学性能，从而得到细菌纤维素/氮化硼复合高导热柔性薄膜材料。