本发明涉及一种磁悬浮电机转子伸长量估算装置及方法，其中，装置包括：第一电感式位移检测装置，用于检测轴端的轴向位移量；第二电感式位移检测装置，用于检测非轴端的轴向位移量；轴向位移产生装置，用于控制转子产生向轴端或非轴端的轴向位移；自适应滤波器，用于产生精确非轴端的实时轴向位移量和轴端的实时轴向位移量；PID调节器，用于计算得到转子位移平衡控制量；伸长量计算装置，用于在转子轴向稳定悬浮后，根据精确轴端的实时轴向位移量确定出转子当前伸长量。本发明能够提高测量的精确性。