本发明公开了基于配置智能发现的CMDB自动化运维管理方法及系统，该方法，包括：基于预设配置项发现规则判断是否存在新增配置项，在确定存在新增配置项时，基于所述新增配置项分析匹配的第一类别链，基于第二类别链相比于第一类别链不同的类别节点创建对应类别的配置项发现规则和对应类别的配置项属性项；针对所有配置项基于预设配置项关系发现规则判断是否存在新增配置项关系；在确定存在新增配置项关系时，更新原有配置项的关系结构图。本发明通过配置项类别链关系和配置项的关系结构拓扑图进行管理，实现对CMDB模型中的所有配置项的新增、异常变化的检测和异常变化发生的关联原因分析。