本发明公开了一种超深碳酸盐岩储层提高导流能力的复合酸压方法及应用。所述方法包括：首先注入低黏低摩阻中性滑溜水造缝，然后注入低黏低摩阻强酸性滑溜水刻蚀已形成裂缝，逐步提高排量循环注入中性滑溜水与酸性滑溜水，逐步扩大酸液的溶蚀范围和缝宽后，从小到大加入不同粒径的自悬浮支撑剂支撑已形成的主裂缝、支裂缝微裂缝系统，最后进行顶替作业。本发明的方法可以有效的提高施工排量和裂缝内净压力，增大酸液的改造范围和溶蚀宽度，有利于自悬浮支撑剂的加入，提高超深层条件下的多类型酸蚀裂缝的导流能力，保持生产的稳定性和长期性。