本发明属于肥料生产技术领域，涉及一种水溶性有机纳米悬浮硅液体肥料及其制备方法和应用，所述液体肥料由以下重量份的各组分制备得到：硅元素32～47份、有机质6～16份、螯合剂0.5～4份、分散剂1～3、乳化剂0.1～2份、防冻剂0.1～3份、增稠剂0.5～3份和水34～43份。本发明利用纳米悬浮技术，在温度为55℃～65℃的条件下，生产出高含量水溶性有机纳米悬浮硅液体肥料；该肥料为含中量元素的有机‑无机悬浮液体肥料，具有硅含量高、吸收效率好、制备工艺简单、生产成本低等优点，可迅速的为水稻补充硅营养，具有提高水稻秸秆抗倒伏能力，提高养分的利用率，促进水稻增产增收，对于水稻种植具有重要的应用价值。