本发明公开了一种芥子碱降解菌的多级优化筛选方法及得到的芥子碱降解菌，包括以下步骤：S1、建立动物模型，在鸡日粮中添加15－25％白芥子饲喂28d及以上；S2、在无菌条件下收集S1的试验鸡肠道内容物，并接种于白芥子液体培养基中培养；S3、取S2中的培养液，并在芥子碱固体培养基上划线，然后置于恒温培养箱培养；S4、在S3的培养基上挑取不同的单一菌落于芥子碱液体培养基中培养即得。本发明首先利用特殊的动物模型创建目标菌种获得条件，再采用独特的分级培养条件创制目标菌种富集纯化培养方法，创立了一套芥子碱降解菌的多级优化筛选模式，能一次性有效筛选出大量芥子碱降解优势菌株，提高了生产效率，解决了现有技术所存在的不足。