本发明属于电力自动化领域，公开了一种跨省区电力现货市场多主体出清方法、系统及计算机设备，包括获取区域中各省内的各国调直调机组及各分中心直调机组的电力消纳方式；根据各国调直调机组及各分中心直调机组的电力消纳方式，将各省内的各国调直调机组及各分中心直调机组，纳入各省交易节点或设为独立交易节点；获取各省交易节点以及各独立交易节点的交易申报信息，并根据各省交易节点以及各独立交易节点的交易申报信息，进行跨省区电力现货市场多主体出清处理，得到跨省区电力现货市场多主体出清结果。通过将国调直调机组及分中心直调机组引入跨省区电力现货市场，补偿省内市场主体出力或负荷的波动，增大交易成交量，降低购电节点的用电成本。