本发明提供了一种城市轨道交通线网调度系统和方法。现有的城市轨道交通线网调度系统指挥层次只有三层，当线网需要调度调整时，由线网调度员给出调整方案，线网调度员需要逐个联系各线路调度员进行调度指挥，线路调度在单一线路内进行调整。本发明提供的城市轨道交通线网调度系统包括了四级指挥层次，分别为线网调度、线路调度、车站调度、信号控制；提出了线路调度与线网调度相结合的方法，可以同时对多条线路进行线网级的运行图编制，实现了对互联互通全线网列车运营的调度方法，突破了以单线为基础的城市轨道交通行车指挥的传统策略，实现不同列车在不同线路上安全运行，尤其是跨线过程中的无缝衔接，在提高互联互通轨道交通运输效率和保障运行安全方面起到了极其重要的作用。