本发明公开一种用于凡纳滨对虾多性状育种的SNP位点引物组合，其包括如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.72序列所示的引物。本发明的SNP位点是通过构建凡纳滨对虾SNP遗传连锁图谱并进行QTL分析获得的，分别与凡纳滨对虾的生长、抗病、耐氨氮、耐亚硝氮性状连锁。在凡纳滨对虾育种实践中，可以应用本发明的SNP位点引物组合，检测凡纳滨对虾育种材料的SNP位点基因型，筛选有利基因型的个体，培育经济性状优良的凡纳滨对虾新品种。