本申请提供一种功率转换器控制方法、控制装置及计算机存储介质，可以在电网电压相位发生大幅跳变情况下保护功率转换器，降低功率反灌程度，降低对电网和功率转换器的冲击。方法包括：确定功率转换器输出的电压的相位角与电网的电压的相位角之间的相位角差值；若相位角差值大于或等于第一角度阈值，将用于确定功率转换器的调制电压的d轴参考电流值和q轴参考电流值设置为预设固定数值；基于d轴参考电流值、q轴参考电流值以及电网的电流，计算功率转换器的第一调制电压；利用预设虚拟电阻参数和电网的电流，计算功率转换器的补偿电压；将第一调制电压和补偿电压的总和作为总调制电压。