本发明提供一种注射用艾司奥美拉唑钠冻干制剂及其制备方，所述注射用艾司奥美拉唑钠冻干制剂由艾司奥美拉唑钠、环糊精和络合剂组成，其中，艾司奥美拉唑钠与环糊精的重量比为55:1～5:1。本发明通过采用环糊精包合艾司奥美拉唑钠形成部分包合物，可有效减少杂质的生成，显著提高产品的稳定性和安全性，从而提高产品的质量和临床治疗效果，明显优于现有技术常见的添加氢氧化钠的注射用艾司奥美拉唑钠冻干制剂，而且本发明的制备方法工艺简单，适合大规模生产。