本发明提供了一种申威1621双处理器计算机组合服务器及布局结构，包括：主板、两块申威1621处理器，两块PEX8748芯片，一块CPLD芯片、两块AST2400芯片、两块网卡芯片；每块所述申威1621处理器配置有八根ECC内存条，每块所述申威1621处理器与一块所述PEX8748芯片连接，每块所述PEX8748芯片均连接有一块所述AST2400芯片，每块所述PEX8748芯片连接有一块所述网卡芯片，两块所述AST2400芯片与CPLD连接。本发明利用PEX8748芯片特有的Multiple Virtual Switches功能，在两个PCIe上游端口中灵活分配下游资源，实现负载均衡。