本发明涉及阿洛酮糖技术领域，具体涉及一种利用模拟移动床从混合糖浆中分离阿洛酮糖的方法。包括：将含D‑阿洛酮糖的混合糖浆，依次经过抽滤、脱色得到溶液Ⅰ；将溶液Ⅰ经过阳离子交换树脂、阴离子交换树脂洗脱除盐，得到溶液Ⅱ；溶液Ⅱ减压浓缩，得到高糖度的浓缩液Ⅲ；浓缩液Ⅲ超声、加热，脱除溶液中的气体，得到溶液Ⅳ；采用模拟移动床分离所述溶液Ⅳ，收集萃取口溶液，将溶液Ⅳ浓缩、结晶和干燥，得D‑阿洛酮糖产品；所述混合糖浆还含有果糖和葡萄糖。本发明采用特定的分离步骤并结合模拟移动床从混合糖浆中分离D‑阿洛酮糖，且D‑阿洛酮糖纯度和收率均较高。