本发明公开了一种海上套管浪涌补偿双驱动三层套管钻探取芯方法，通过动力定位系统将将钻探船定位于设定的经纬坐标，通过海底基盘稳定钻杆，通过井口套管浪涌补偿在套管钻进时能传递扭矩和钻压，取样钻进时，浪涌补偿能在一定范围内补偿因涨潮、落潮或浪涌引起的水深变化，防止套管冲撞设备，保证井口作业安全，通过双驱动头实现三层套管钻进，有效保护井壁，使钻进取样取芯率高，取芯质量好。与普通的钻探方法相比，本发明具有钻探效率高、取芯率高，设备简单，可靠性高，成本低等优点，不仅适用于一般沉积岩地层浅钻，而且适用于难取芯地层，如礁灰岩地层，砂土层。