本发明提供了一种外来经济作物受本地经济作物传粉影响的鉴定方法，涉及林业种植技术领域。本发明利用不同物种间的生殖隔离，如花朵柱头上接纳了异种花粉，则该物种就不能正常受精和结实，将最终导致种子产量的下降。本发明基于虫媒携带的花粉比例、植物柱头花粉比例和进入结实期后所测定的坐果率，这3个逐层递进的指标来进行综合判定。对于某种外来经济作物而言，如果混C显著低于纯C(混：混交林；纯：纯林；C为坐果率)，并且混K本(K：昆虫；本：本地花粉比例)和混Z本(Z：柱头)均大于50％，则判定本地经济作物对外来经济作物的传粉和结实产生了显著的负面影响，并且是造成外来经济作物种子产量降低的本质因素。