本发明提供一种防止和应涌流引起变压器差动保护误动的闭锁方法，属于电力自动化技术领域。包括：计算变压器三相差动电流值；判断所述变压器发生和应涌流时所述差动电流中的二次谐波相位与2倍基波电流相位之间是否存在相位差；判断出所述变压器发生和应涌流时所述差动电流中的所述二次谐波相位与2倍所述基波电流相位之间存在所述相位差时，计算所述变压器发生和应涌流及故障时的二次谐波比例值；判断所述二次谐波比例值是否均不低于比例系数Kd；判断出所述二次谐波比例值均低于所述比例系数Kd时，判断所述差动电流的电流值是否不低于整定值Iset；判断出所述差动电流的电流值低于所述整定值Iset时，闭锁差动保护。