本发明提供一种基于免疫沉淀法提取生物样品中免疫多肽的分析方法，属于免疫多肽分析技术领域，通过交联试剂制备免疫亲和柱，再对生物样本的裂解物进行免疫沉淀，从而富集得到HLA‑肽段复合物，再通过C18小柱进行一个简单的两步洗脱，该步骤可以同时实现免疫多肽的除杂和脱盐，回收的成分即可在浓缩后进行质谱检测，可以实现无论是细胞还是组织等生物样本中免疫多肽的高效提取，样品前处理过程不依赖复杂的仪器，即可完成免疫多肽的纯化和除盐，大大缩短操作所需时长。