本发明提供一种H桥驱动电路的钳位保护功能控制系统，其包括一芯片外部的H桥驱动电路，其第一侧和第二侧的下管的连接点为采样点，其通过采样电阻接地，该采样点同时与第一侧位保护功能电路和第二侧钳位保护功能电路相连，第一侧钳位保护功能电路设置为：在电流换相过程中的续流阶段，驱动第一侧的下管弱导通；第二侧钳位保护功能的功能类似。本发明还提供相应的钳位保护功能控制方法。本发明的H桥驱动电路的钳位保护功能控制系统通过设置钳位保护功能电路将原本截止的下管变为弱导通，将续流路径变为以下管续流为主，使得采样电阻上负压变小，有效解决了换相控制续流阶段对电源或H桥开关管的冲击，便于保护系统安全，增强可靠性。