本发明公开一种正电性金纳米簇及其制备方法与应用，属于功能性生物纳米材料技术领域。该正电性金纳米簇通过把氨基或胍基与硫辛酸相连后作为配体分子与氯金酸及硼氢化钠反应获得。本发明的正电性金纳米簇的制备方法简单，操作性强，成本低，易于大规模制备；材料表面亲水性强，避免了纳米粒子的团聚，生物相容好，毒性低，发射荧光涵盖红光～近红外波段，易于与生物组织的自发荧光区分，对细胞核的靶向性高，与细胞孵育后主要富集在细胞核内，其中硫辛酸‑氨基乙基胍作为配体合成的金纳米簇相比于以硫辛酸‑乙二胺为配体合成的金纳米簇的细胞核靶向性更明显，可用于细胞核标记、核酸转染等，在生物医学领域有潜在的应用价值。