本申请公开了一种配电网故障行波信号处理方法及装置，其中方法包括：获取待处理的故障行波信号；通过VMD分解处理算法，对故障行波信号进行分解处理，得到模态分量；通过时间序列复杂度度量方法，计算模态分量的样本熵值；根据样本熵值与预设的样本熵阈值的比较结果，将样本熵值大于样本熵阈值的模态分量进行滤除；基于剩余的模态分量，生成故障信号序列。本申请提供的配电网故障行波信号处理方法基于通过VMD分解处理算法对故障行波信号进行分解处理得到的模态分量，然后分别计算模态分量的样本熵值，将样本熵值较高的模态分量视为非平稳随机噪声进行滤除，实现对故障行波信号的去噪得到精度更高的行波信号，从而提高故障定位精度。