本发明涉及一种使化肥减量增效的微生物肥料及其制备方法与应用，所述使化肥减量增效的微生物肥料包括生物炭、复合发酵菌剂、复合功能菌剂和有机物料；所述复合发酵菌剂包括枯草芽孢杆菌菌粉、嗜热链球菌菌粉和乳酸克鲁维酵母菌菌粉；所述复合功能菌剂包括胶冻样类芽孢杆菌菌粉、嗜酸红芽菌菌粉和甲基营养型芽孢杆菌菌粉。本发明提供的使化肥减量增效的微生物肥料肥效稳定，可降低化肥施用量，且能够促进植株生长、减低植株的患病率和死亡率，提高作物产量，增加经济创收，在蔬菜的种植中具有重要的应用价值。