本发明涉及一种细菌，该细菌为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)WY2；保藏地点：北京市朝阳区大屯路，中国科学院微生物研究所，保藏编号为CGMCCNo.6662。本发明的贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)WY2能实现对烟草根腐病的有效控制，相对防效在以上60％；还对黑胫病菌、灰霉病菌、菌核病菌、靶斑病菌、霉变病菌、赤星病菌等具有很好的抑菌作用。本发明的防治效果好，具有较高的推广应用价值。