本发明公开了一种基于光谱相似度和化学指标差异度的样本筛选及建模方法，通过考察样本集中的最相似样本对及化学指标差异度之间的关系。通过衡量样本相似程度，得出在高相似度下的两样本，其化学值应有的差异范围。随着相似度值的降低，最大化学指标差异度升高，具有这样趋势的样本才是有效样本，无论采用何种建模方式均能够很好地建立光谱与化学指标之间的关系。若这种趋势无法体现，则说明该批数据缺乏光谱关于化学指标之间的区分度，因此无法成功建模。因此，该方法有助于使用者及时排除建模方法不当、建模样本较少等因素，较为明确地给出该批数据是否可以建模，从而节省必要的人力物力，对建模及数据分析水平较低的使用者尤为适合。