本申请实施例公开了一种多端口共高频电能路由器控制方法和系统，所述方法包括：建立多端口共高频电能路由器的数学模型，以确定目标解耦环节；根据目标解耦环节的d、q轴的分量，将稳压分量作为q轴给定，将无功分量作为d轴给定，以实现双闭环外环的控制；建立SVPWM调制方式下的解耦控制方法，其调制信号Vabc由二次解耦公式并通过坐标变换得来的Vα、Vβ变换得到；将调制信号Vabc与目标正弦波形相比较得到调制信号fm，通过调制信号发生器得到多端口共高频电能路由器开关信号。实现了控制电网与路由器系统功率交换的功能，也可抑制路由器向电网注入的谐波。