本发明公开了一种方波包络型微小拓扑信号发生系统及方法，本发明包括：处理器单元、隔离驱动单元、MOS驱动单元、恒流负载单元、稳压单元、过热保护单元；所述隔离驱动单元、处理器单元、温度采集单元由直流电源供电；所述处理器单元通过导线与隔离驱动单元电性输入连接，所述隔离驱动单元通过导线与MOS驱动单元电性输入连接，所述MOS驱动单元通过导线与稳压单元电性输出连接，所述MOS驱动单元通过导线与所述恒流负载单元电性输入连接，所述过热保护单元通过PCB耦合方式与恒流负载单元连接。本发明通过处理器单元控制驱动单元，从而控制恒流负载单元产生方波包络特性的具备特征频率的可实现低压台区采集设备拓扑关系识别的微小拓扑信号。