本发明公开了一种复合型电迁移钢筋阻锈剂及其制备方法。本发明所述钢筋阻锈剂由电迁移阻锈组分、正电修饰的纳米二氧化硅、渗透组分及溶剂组分混合而成；所述电迁移阻锈组分为有机胺和碱性氨基酸以任意比例复合而成的混合物，所述正电修饰的纳米二氧化硅由硅烷偶联剂与纳米二氧化硅发生接枝反应制得，所述渗透组分选自磷酸酯、聚氧乙烯醚的一种或两种以任意比例混合，所述溶剂组分为水。本发明所述钢筋阻锈剂对既有结构混凝土密实性进行改善，将既有结构的钢筋阻锈防护和基体密实防护设计在一起，且基体密实防护可以有效减少阻锈防护组分的溶出并阻挡氯离子、硫酸根离子进一步侵蚀混凝土基体和钢筋。