本申请涉及一种色谱图异常处理方法、存储介质及电子设备，涉及色谱仪技术领域，该方法包括以下步骤：实时存储检测获得的第一色谱图；调取色谱仪中用户信息对应的第一色谱图；统计第一色谱图中的空气峰总数、平顶峰总数或连续峰总数；根据空气峰高度和空气峰宽度、根据平顶峰顶宽度和平顶峰高度差或根据连续峰宽度和连续区域宽度，处理第一色谱图。本申请基于色谱图的异常情况，进行适当的处理工作，以规避色谱仪自身误差或用户使用误差，在一定程度上为色谱仪的检测结果的可靠性提供保障。