本发明涉及饲料添加剂技术领域，且公开了一种基于噬菌体生物饲料添加剂制备方法，包括以下步骤：S1：噬菌体裂解液，先培养噬菌体，噬菌体成产菌种，并对其进行裂解处理，收集裂解液备用；S2：制备噬菌体储备液，先进行培养基配制，然后缓缓加入氯化钙、氯化镁进行混合，混合时进行加热，制备噬菌体储备液；S3：扩培发酵。本发明采用二次接种发酵工艺，解决传统方式发酵的目标物浓度低的问题，同一个发酵罐多菌种发酵工艺，解决了单一菌种发酵投资大生产效率低的问题，采用微滤加超滤的纯化浓缩工艺，不仅能分离溶液中的小分子蛋白及其他各种营养物质还能有效提高目标物浓度延长保质期限。