本发明涉及油田化学领域，公开了一种二维纳米材料强化清洁压裂液及其制备方法与应用。基于所述二维纳米材料强化清洁压裂液的总重，所述压裂液包括：二维纳米材料0.005‑0.03wt％、黏弹性表面活性剂0.5‑3wt％、反离子助剂0.5‑2wt％和水94.97‑98.995wt％；其中，所述二维纳米材料为改性二维纳米二硫化钼。本发明提供的压裂液能够兼具压裂和渗吸排驱的双重功效，具有更高的耐剪切性能和黏弹性，所用二维纳米材料可通过简单工艺制备获得，利于工业推广。