本发明公开一种基于非均匀沙起动的海底冲刷区确定方法，首先收集目标海域的每个采样点的水深和底质特征相关参数，确定泥沙级配情况，采用非均匀沙起动公式计算泥沙分级起动流速；选定目标海域，确定海洋动力模型的整体范围，收集该海域水深与海岸线数据以及模拟台风暴潮需要的台风数据；构建风暴潮数值模型，进行数值模拟，提取目标海域风暴潮流速场时间变化，得到每个网格点的风暴潮最大流速；通过数学插值将目标海域每个采样点计算得出的分级起动流速插值到数值模型网格节点上，比较每个网格节点的风暴潮最大流速和多个粒级的起动流速，确定冲刷点；汇总所有存在冲刷网格节点，得出海底冲刷区。该冲刷区的确定能为海缆铺设施工提供科学指导。